孫雙文於1993年得法。99年大法遭受迫害以來，孫雙文多次遭到中共的迫害。99年在大同市看守所被非法關押8個月，回來後為躲避騷擾，被迫流離在外。
2000年12月孫雙文再次被綁架，惡警將其轉至原籍忻州代縣，忻州地區法院將他非法判刑四年。法庭上孫雙文義正詞嚴，駁斥了惡人的謊言，證實大法，發言使許多人折服，包括法官在內都暗自佩服，許多犯人在看守所和他一起學法煉功。
在祁縣監獄（山西省第一監獄），孫雙文拒不接受所謂的「轉化」，遭到了嚴重的迫害，曾被關小號，犯人用木凳子毒打……2004年，惡警王文洲指使犯人毒打孫雙文，打得孫雙文奄奄一息，昏死過去時，他們仍不罷休，又給孫雙文戴上背銬抬到禁閉室，監獄內看守隊惡警親自動手毒打，孫雙文被折磨得遍體鱗傷，被迫害得不能走路。
2004年底孫雙文回到家中，當地派出所、610惡人經常對他的騷擾，2006年11月7日中共在大同市綁架了三十多名大法弟子，孫雙文再次流離失所。
孫雙文2007年秋在繁峙縣集義莊鄉講真相被不明真相的人舉報，遭鄉派出所綁架，由縣公安局帶走迫害，關在縣看守所。中共非法開庭，重判六年，送往祁縣監獄繼續迫害。