許多人對法輪功受到中共迫害表示關注，一位日本老人在看到了法輪功受迫害的圖片之後表示：「中共比北韓恐怖，中共的專制體制不解體，始終是隱患。我支持你們（法輪功）。」
日本法輪功學員曾經在一九九九年和二零零一年兩次向東京都申請註冊成立NPO法人，由於受到中共駐日大使館的干擾，以及東京都政府對法輪功的不瞭解，而沒有被認定。直到二零零四年，法輪功學員第三次申請註冊成立NPO法人的時候，獲得了認定。東京都政府在批准時明確表示：法輪功「既沒有政治色彩，也沒有宗教色彩，符合法律上的必要條件」。東京都知事石原慎太郎曾經在二零零四年三月八日的《產經新聞》上撰文披露，中共駐日大使館對法輪功申請非營利性團體法人多次阻撓的情況。
日本NPO節每年十月舉辦，由一些NPO團體組成的執行委員會作為主辦單位，後援單位包括日本經濟產業省、農林水產省、外務省和環境省。日本在一九九八年通過了「特定非營利活動促進法」，以增進保健、醫療、福利，推動社會教育，推進社區建設，振興學術、文化、藝術和體育，環保人權和救災等十七項內容。