现代人们所说的科学，通常是指西方实证科学。事实是，科学根本就未曾否定过神的存在。科学是人类通过实证的方法去探索自然的活动，其基本特点是怀疑一切未经科学实验证实的东西，但同时也不否定任何未经证伪的东西。在有神还是无神这个问题上，科学根本没有结论。
科学与有神信仰的区别，仅在于认识事物的方法，而不在于对有神还是无神这个问题的回答。
与科学家不同的是，信仰者对神佛的信仰不需要科学证据来验证，但这并不是说自然界不存在这样的证据。用科学来否定神佛的存在，完全是一个逻辑错误。
“科学”与有神信仰的区别，仅在于认识事物的方法。如：经络摸不着、西医解剖也看不到，然而几千年前的中国古人却通过修炼，准确地知道了经络。现代人通过科技手段印证了其真实存在，却相差了几千年！谁的方法更先进、更科学呢？