然而，一九九九年七月后中共血腥迫害法轮功，逼她放弃修炼法轮功，侮辱给她第二次生命的恩师。刘桂锦不愿做忘恩负义的小人，也为她自己的健康，坚持修炼法轮功，因此遭遇中共当局各级人员残酷迫害，被折磨得死去活来；曾被戴上十八斤的大镣二十天，当时双腿被折磨坏了。
在汶川大地震发生的第二天，二零零八年五月十三日晚，刘桂锦在北京顺义区家中第三次遭到公安警察绑架、抢劫。随后，刘桂锦被非法劳教二年，在北京奥运之前，与其他五十多位北京法轮功学员一同被秘密送往辽宁省沈阳市臭名昭著的马三家劳教所迫害。
直到二零一零年五月十二日，刘桂锦才被释放回到户口所在地唐山。中共警察抢劫的财物，包括七千元现金，至今没有归还给她。