病魔使他常常无法入睡，不敢脱衣上床，因一碰就出血，衬衣粘在肉上更难受痛苦极了，无奈只好和衣靠在沙发上，长了十五年的牛皮癣，使他活的痛不欲生，讨治各种偏方，各大医院医治也没治好。几次去黑龙江五大连池疗养，也不见好转。九七年四月份被五大连池疗养院送回，说他的病已经不能治了，回家准备后事，他绝望地从五大连池返回家。
一九九七年五月，就在他绝望之时，有好心人告诉他：“只有大法能救你，你快修炼吧。”他半信半疑，还不很情愿地开始看《转法轮》这本书，谁知越看身体越舒服，一气看了一百多页，异常激动，都半夜了他还兴奋地抓起话筒给姐姐打电话，姐姐非常紧张，以为弟弟病危了，可一听是弟弟病情好转了，才舒口气。第二天倪文奎把烟酒都戒了，到炼功点开始学法炼功。
修炼法轮功后，他按真善忍标准做好人。随着道德提升和思想境界的升华，三十多天后，他一身牛皮癣全好了，工作也上进了，全厂人都震惊了。次年他被单位评为先进个人，开表彰大会时他代表劳模发言，公司领导对厂长说：“他以前奇特的皮肤病，一炼法轮功全好了，恶习也没了。”此后他连年被单位评为先进个人。
在一九九九年七月中共邪党迫害法轮功后，倪文奎上省政府上访，用自己亲身经历讲法轮功真相，遭到中共警察的绑架、非法关押、判刑，在大庆监狱遭到单独监禁、不让睡觉、洗脑、冷水浇、毒打、电击等多种酷刑迫害，导致身体瘦骨嶙峋，象植物人一样，于二零零七年十一月十二日含冤离世，时年四十二岁。